В соответствии с пп. 5 п. 1 ст. 162 ч. 2 НК РФ в налоговую базу включают суммы санкций, полученные за неисполнение или ненадлежащее исполнение договоров. Неустойки (штрафы, пени), которые определяются в зависимости от длительности просрочки исполнения обязательства, облагаются НДС только в части, превышающей сумму, исчисленную по ставке рефинансирования Банка России. Однако при получении разовых штрафов за неуплату налоговая база будет рассчитываться с учетом всего полученного штрафа. С этой точки зрения неустойки выгоднее устанавливать в виде пеней, т.е. санкций, зависящих от количества дней просрочки.
Налогообложению подлежат лишь те суммы санкций, которые получены по договорам поставки товаров, работ и услуг, выручка по которым облагается НДС.
Сумму НДС нельзя взыскивать "сверх" суммы санкций, а значит, ее следует начислять расчетным путем (16,67% или 9,09%).

Из заданного вопроса возникает другой вопрос - почему аванс, полученный в счет будущего вознаграждения по договору поручения, не является денежными средствами данного предприятия, если в дальнейшем услуга по данному договору оказана?
А для включения амортизации по приобретенным автомобилям в себестоимость услуг предприятия необходимо выполнение следующих условий:

• Произвести ввод основных средств, в частности, автомобили должны быть заприходованы, пройти регистрацию и быть в эксплуатации. Обязательно должны выписываться путевые листы, где указываются служебные поездки.
• Автомобили должны стоять на балансе данного предприятия.
• Основные средства должны быть приобретены за счет средств предприятия.

Основание: Положение о составе затрат № 552.

В Письме МНС № ВГ-6-02/139 (вопрос 19) даны разъяснения, что возмещение балансовой стоимости основных фондов предприятий осуществляется путем включения амортизационных отчислений по утвержденным единым нормам в издержки производства в течение нормативного срока их использования.

Такой порядок распространяется на основные средства, приобретенные за счет собственных источников организации.

В случае, если источником приобретения основных средств не являются собственные средства предприятия (т.е. отсутствуют расходы по приобретению), то амортизация в себестоимость для целей налогообложения не включается. Следует учесть, что в нашем случае расходы присутствуют. Предприятия само приобретает автомобили. А на денежные средства, в виде аванса за будущие услуги, ни одним нормативным документом не наложен "арест".

Приказом Минфина России от 31 декабря 2000 г. № 94н утвержден новый план счетов бухгалтерского учета финансово-хозяйственной деятельности организаций и Инструкция по его применению, переход на ведение которого организации осуществляют в течение 2001 г. по мере готовности.

Следовательно, организации имеют право в 2001 г. применять План счетов бухгалтерского учета финансово-хозяйственной деятельности предприятий и Инструкцию по его применению, утвержденные Приказом Минфина СССР от 1 ноября 1991 г. № 56, а с начала 2002 г. отражать хозяйственные операции с использованием нового Плана счетов. Поэтому не будет никакой ошибки в том, что МБП в первом квартале были заприходованы по старому плану счетов.

ПБУ 6/01 было подписано 30.03.01 и, несмотря на указание в этом ПБУ, что оно вводится, начиная с бухгалтерской отчетности 2001 г., следует заметить, что официально оно было опубликовано лишь в мае 2001 г.

Также введение МБП на 12 счете, а не на 01 не искажает бухгалтерскую отчетность, если в учетной политике отмечено, что списание МБП происходит сразу на все 100 %.

Положением по бухгалтерскому учету "Учет основных средств" ПБУ 6/01 (п. 23) и Методическими указаниями по бухгалтерскому учету основных средств (Приказ № 33н) не предусматривается исключение основных средств, находящихся в запасе (резерве) и принадлежащих организации на праве собственности, хозяйственного ведения, оперативного управления, из состава объектов для начисления амортизации.

Согласно п. 53 Методических указаний начисление амортизационных отчислений не приостанавливается в течение срока полезного использования объектов основных средств кроме случаем их нахождения на реконструкции и модернизации по решению руководителя организации, и по основным средствам, переведенным по решению руководителя организации на консервацию с продолжительностью, которая не может быть менее трех месяцев.

При этом п. 1 Положения о порядке начисления амортизационных отчислений по основным фондам в народном хозяйстве (утв. Госпланом СССР, Минфином СССР, Госбанком СССР, Госкомцен СССР, Госкомстатом СССР, Госстроем СССР 29.12.90 № ВГ-21-Д/144/17-24/4-73 (№ ВГ-9-Д)), которое также продолжает действовать в настоящее время, прямо предусмотрено, что в состав объектов основных средств начисления амортизации входят оборудование и транспортные средства, находящиеся в запасе (резерв на складе) и числящиеся на балансе основной деятельности действующих предприятий.

На основании изложенного можно сделать вывод, что амортизационные отчисления на полное восстановление основных производственных фондов, находящихся в запасе (резерве), по установленным нормам следует включать в себестоимость продукции (работ, услуг).